En mi laptop con windows 7, tenía instalado el jdk 1.7 el cual tenia un inconveniente con el firewall de windows, y da problemas al subir archivos a través de netbeans a un servidor remoto. Desabilitando el firewall de windows el proceso funcionaba bien.
No importa si pones exepciones de el ejecutable de java en la configuración del firewall. me refiero a estos:
(java.exe) (javaws.exe)
C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_30
C:\Program Files\Java\jdk1.7.0
Así que lo primero es proceder a eliminar el JDK1.7
(Reiniciar windows)
Editar la configuración de netbeans
C:\Program Files\NetBeans 7.1.1\etc\netbeans.conf
# Default location of JDK, can be overridden by using --jdkhome <dir>:
netbeans_jdkhome="C:\Program Files\Java\jdk1.7.0"
Cambiar por:
netbeans_jdkhome="C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_30"
O la instalacion que tengas actualmente en tu OS.